A Produção Científica da Faculdade de Ciências Médicas de São José dos Campos será proveniente das atividades fomentadas e regulamentadas pelo Núcleo de Desenvolvimento Cientifico e Tecnológico - NDCT da Faculdade, que acompanha e auxilia no desenvolvimento de todos os projetos elaborados pelo corpo docente e com os estudantes.

Constituem campo para pesquisa: práticas investigativas, atividades de iniciação cientifica, atividades de extensão, pesquisas desenvolvidas por linhas (segundo a área de conhecimento) ou por grupos de pesquisa (formado por docentes e discentes da Instituição), além dos trabalhos de conclusão de curso (de graduação e pós-graduação). Quando a pesquisa envolve seres humanos, precisa, obrigatoriamente , ser previamente submetida ao Comitê de Ética em Pesquisa.

Outra fonte de estudo serão as práticas cotidianas dos cenários de prática da FCM/SJC – Humanitas.